Un aspect esențial al relațiilor moldo-israeliene îl reprezintă cadrul juridic bilateral, ce acoperă în prezent aproape toate domeniile de cooperare: economic, medicină și sănătate, cultură, învățământ, știință, sport, agricultură, vamal, turism, conversiunea permiselor de conducere, cooperare juridică, precum și standardizare. În particular menționăm următoarele acorduri:

Memorandum privind colaborarea între Guvernul Republicii Moldova şi Guvernul Statului Israel.

• Semnat la Ierusalim la 03.05.1993.
• În vigoare din 03.05.1993.

Acord privind transporturile aeriene între Guvernul Republicii Moldova şi Guvernul Statului Israel.

• Semnat la Ierusalim la 22.06.1997.
• În vigoare din 13.01.1998.

Acord privind comerțul şi cooperarea economică între Guvernul Republicii Moldova şi Guvernul Statului Israel.

• Semnat la Ierusalim la 22.06.1997.
• În vigoare din 01.05.1998.

Acord între Guvernul Republicii Moldova şi Guvernul Statului Israel privind promovarea şi protejarea reciprocă a investiţiilor.

• Semnat la Ierusalim la 22.06.1997.
• În vigoare din 16.03.1999.

Acord între Guvernul Republicii Moldova şi Guvernul Statului Israel cu privire la colaborarea în domeniul medicinii şi sănătăţii.

• Semnat la Ierusalim la 22.06.1997.
• În vigoare din 27.07.1998.

Protocol cu privire la consultările între Ministerul Afacerilor Externe al Republicii Moldova şi Ministerul Afacerilor Externe al Statului Israel.

• Semnat la Ierusalim la 22.06.1997.
• În vigoare din 22.06.1997.

Protocol privind aranjamentele specifice în domeniul învățământului între Guvernul Republicii Moldova şi Guvernul Statului Israel.

• Semnat la Ierusalim la 22.06.1997.
• În vigoare din 22.06.1997.

Protocol între Guvernul Republicii Moldova şi Guvernul Statului Israel privind instituirea reciprocă a centrelor culturale şi a activităţii acestora.

• Semnat la Ierusalim la 22.06.1997.
• În vigoare din 23.02.1998.

Acord de colaborare în domeniul culturii, învățământului, ştiinţei, tineretului şi sportului dintre Guvernul Republicii Moldova şi Guvernul Statului Israel.

• Semnat la Ierusalim la 22.06.1997
• În vigoare din 12.02.1998.

Acord între Guvernul Republicii Moldova şi Guvernul Statului Israel cu privire la abolirea vizelor pentru titularii pașapoartelor diplomatice şi de serviciu.

• Semnat la Ierusalim la 22.06.1997.
• În vigoare din 15.02.1998.

Acord privind introducerea articolului 6 în textul în limba română a Acordului de colaborare în domeniul culturii, învățământului, ştiinţei, tineretului şi sportului dintre Guvernul Republicii Moldova şi Guvernul Statului Israel.

• Semnat la Chişinău la 24.09.1994.
• În vigoare din 24.09.1997.

Acord între Guvernul Republicii Moldova şi Guvernul Statului Israel cu privire la cooperarea în domeniul agriculturii.

• Semnat la Ierusalim la 26.04.1999.
• În vigoare din 16.09.2000.

Acord între Guvernul Republicii Moldova şi Guvernul Statului Israel privind cooperarea în domeniul combaterii traficului ilicit şi abuzului de stupefiante, substanţe psihotrope şi a altor crime grave.

• Semnat la Chişinău la 10.07.2003.
• În vigoare din 14.01.2004.

Acord între Guvernul Republicii Moldova şi Guvernul Statului Israel privind cooperarea tehnică în domeniul gospodăriei rutiere.

• Semnat la Chişinău la 10.07.2003.
• În vigoare din 03.02.2004

Acord între Guvernul Republicii Moldova şi Guvernul Statului Israel cu privire la asistenţa administrativă reciprocă în domeniul vamal.

• Semnat la Ierusalim la 22.11.2004.
• În vigoare din 07.06.2005.

Acord între Guvernul Republicii Moldova şi Guvernul Statului Israel privind colaborarea în domeniul turismului.

• Semnat la Ierusalim la 22.11.2004.
• În vigoare din 22.03.2005.

Acord între Guvernul Republicii Moldova şi Guvernul Statului Israel cu privire la colaborarea în domeniul standardizării, metrologiei şi evaluării conformităţii.

• Semnat la Ierusalim la 22.11.2004.
• În vigoare din 08.05.2006.

Acord între Guvernul Republicii Moldova şi Guvernul Statului Israel privind cooperarea în domeniul protecţiei mediului.

• Semnat la Ierusalim la 14.05.2012.
• În vigoare din 26.06.2012

Convenţie între Guvernul Republicii Moldova şi Guvernul Statului Israel pentru evitarea dublei impuneri şi prevenirea evaziunii fiscale cu privire la impozitele pe venit şi pe capital.

• Semnat la Tel-Aviv la 23.11.2006.
• În vigoare din 22.02.2007.

Memorandum de Înţelegere între Centrul pentru combaterea crimelor economice şi corupţiei al Republicii Moldova şi Agenţia privind interzicerea spălării banilor şi finanţării terorismului a Statului Israel (IMPA) privind cooperarea în schimbul de informații referitoare la spălarea banilor și finanțarea terorismului.

• Semnat la Chişinău la 12.10.2010.
• În vigoare din 19.12.2010.

Acord între Guvernul Republicii Moldova şi Guvernul Statului Israel cu privire la angajarea temporară a lucrătorilor din Republica Moldova în anumite sectoare din Statul Israel.

• Semnat la Ierusalim la 16.10.2012.
• În vigoare din 06.01.2013.

Protocol de implementare A pentru Acordul între Guvernul Republicii Moldova şi Guvernul Statului Israel cu privire la angajarea temporară a lucrătorilor din Republica Moldova în anumite sectoare din Statul Israel (sectorul construcțiilor).

• Semnat la Ierusalim la 16.10.2012.
• În vigoare din 06.01.2013.

Acord între Guvernul Republicii Moldova și Guvernul Statului Israel privind procedurile de conversiune a permiselor de conducere.

• Semnat la Ierusalim la 20.03.2024.
• În vigoare din 27.10.2024.

Acord între Guvernul Republicii Moldova si Guvernul Statului Israel cu privire la cooperarea juridică în materie civilă si comercială.

• Semnat la Ierusalim la 27.05.2025.
• Nu este în vigoare. Părțile îndeplinesc procedurile interne necesare.

De asemenea, pe lângă acordurile existente, relațiile moldo-israeliene se bazează și pe documente de cooperare interinstituțională, care nu intră în categoria tratatelor internaționale:

• Aranjament de asistență mutuală între Agenția „Invest Moldova” și Institutul de Export și Cooperare Internațională din Israel, semnat la Tel Aviv la 21.06.2023
• Memorandum de Înțelegere între Spitalul Clinic Republican „Timofei Moșneaga” din Republica Moldova și Corporația Medicală „Rambam” din Statul Israel, semnat la Haifa la 02.04.2024
• Memorandum de Înțelegere între Agenția Națională a Arhivelor din Republica Moldova și Arhiva Centrală pentru Istoria Poporului Evreu din Statul Israel în domeniul arhivistic, semnat la Ierusalim la 29.07.2024
• Memorandum de Înțelegere între Agenția Națională a Arhivelor din Republica Moldova și Yad Vashem din Statul Israel în domeniul arhivistic, semnat la Ierusalim la 30.07.2024
• Memorandum de Înțelegere între Agenția Națională a Arhivelor din Republica Moldova și Arhiva de Stat a Israelului, semnat la Ierusalim la 31.07.2024
• Declarație de Intenții între Ministerul Agriculturii și Industriei Alimentare al Republicii Moldova și Ministerul Agriculturii și Securității Alimentare al Statului Israel privind cooperarea în domeniul agriculturii, semnată la Chișinău la 03.09.2025